Управление командующего войсками ПВО ТС включало штаб, управление истребительной авиации, управление зенитной артиллерии и другие органы. Зоны ПВО на Европейской части СССР были расформированы, на их основе созданы Московский и Ленинградский корпусные районы ПВО, Архангельский, Череповецко-Вологодский, Рыбинско-Ярославский, Ряжско-Тамбовский, Воронежско-Борисоглебский, Горьковский, Казанский, Пензенский, Куйбышевский, Саратовско-Балашовский, Сталинградский, Краснодарский и Грозненский дивизионные районы ПВО. В Закавказье и Сибири оставлены Закавказская, Среднеазиатская, Забайкальская и Дальневосточная зоны ПВО. В конце 1941 – начале 1942 года были созданы три новых дивизионных района ПВО: Мурманский, Ростовский и Уральский.

Противовоздушную оборону Москвы осуществляли 1-й корпус ПВО и 6-й истребительный авиационный корпус. В ночь на 22 июля 1941 года немецко-фашистская авиация совершила первый массированный налет на Москву. В налете участвовали около 220 бомбардировщиков, которые шли на столицу четырьмя эшелонами с интервалами 30 – 40 минут. В ходе отражения первого налета было израсходовано 16 000 снарядов среднего калибра, 13 000 снарядов малого калибра и 130 000 пулеметных патронов. Огнем зенитной артиллерии и зенитных пулеметов сбито 10 бомбардировщиков противника.⁹

Управление 1-го корпуса ПВО РККА было образовано в феврале–апреле 1938 года и просуществовало до 17 декабря 1941 года. Командовал корпусом генерал-майор Тихонов. В самые напряженные дни войны, когда враг стоял под Москвой, на его базе было сформировано управление Московского корпусного района ПВО. Командиром корпуса назначен генерал-майор артиллерии Д.А.Журавлев. На 22 июня 1941 года в состав 1-го корпуса ПВО входило 6 зенитных артиллерийских полков среднего калибра, 1 зенитный пулеметный полк, 2 полка аэростатов заграждения, 2 прожекторных полка и 2 полка ВНОС. На основании приказа Народного комиссара обороны СССР И.В.Сталина от 6 апреля 1942 года на базе корпусного района сформировано управление Московского фронта ПВО.

С начала боевых действий до конца 1941 года зенитной артиллерией ПВО на оборонуе Москвы было израсходовано 741 000 снарядов среднего калибра, из них при постановке заградительного огня – 715 000 снарядов. Система ПВО Москвы была достаточно эффективной.